NGHIÊN CỨU HOẠT TÍNH CỦA MỘT SỐ HỢP CHẤT TỰ NHIÊN ỨC CHẾ VI KHUẨN VÒM HỌNG (Streptococcus pyogenes) BẰNG MÔ PHỎNG DOCKING PHÂN TỬ
https://doi.org/10.64302/joshusc.v29n2.1234
Trần Quang Huy, Phạm Văn Vinh, Nguyễn Vĩnh Phú, Phan Tứ Quý, Bùi Quang Thành, Nguyễn Thị Thanh Hải, Nguyễn Thị Ái Nhung
Email: ntanhung@hueuni.edu.vn
Một số hợp chất tự nhiên: (C1) Tetradecanoic acid, (C2) 6,10,14-trimethyl-2-pentadecanone, (C3) n-Hexadecanoic acid, (C4) 9,12-Octadecadienoic acid, (C5) Tricosane, (C6) Tricyclo[6.3.1.0(1,5)]dodecan-9-ol,2-benzoyloxy-4,4,8-trimethyl, (C7) 24-Norursa-3,12-diene, (C8) Spirost-5-en-3-ol, acetate (C9) Cholesta-3,5-dien-7-one và thuốc đối chứng Penicillin G (D) được chọn để khảo sát khả năng ức chế protein P0C0C7 bằng phương pháp mô phỏng docking phân tử. Nghiên cứu đã xác định được vị trí hốc của protein ở 1 và 3 là vị trí tối ưu cho quá trình docking và kết quả chỉ ra rằng protein P0C0C7 bị ức chế bởi các hợp chất C1-C9 và D theo thứ tự: D > C8 > C6 > C4 > C3 > C1 > C9 > C2 > C5 > C7. Các hợp chất C1-C9 có tiềm năng trong việc ức chế protein P0C0C7 của vi khuẩn vòm họng (Streptococcus pyogenes) và kết quả mô phỏng này sẽ được dùng để định hướng cho các nghiên cứu thực nghiệm trong tương lai.