NGHIÊN CỨU KHẢ NĂNG BẢO VỆ THỤ THỂ CHỦ ACE2 VÀ ỨC CHẾ SPIKE PROTEIN 6VSB CỦA SARS-CoV-2 TỪ MỘT SỐ DẪN XUẤT PHENYLPROPENE BẰNG PHƯƠNG PHÁP MÔ PHỎNG LẮP GHÉP PHÂN TỬ
Bùi Quang Thành, Nguyễn Vĩnh Phú, Nguyễn Hoài Bảo, Phan Tứ Quý, Trần Thị Ái Mỹ, Nguyễn Thị Thanh Hải, Nguyễn Thị Ái Nhung
Các dẫn xuất phenylpropene gồm chavicol acetate (A1), eugenol (A2), trans-isoeugenol (A3) và eugenol acetate (A4) được nghiên cứu bằng mô phỏng lắp ghép phân tử với việc ức chế thụ thể ACE2 và protein gai sừng (spike protein) (6VSB) của SARS-CoV-2. Kết quả mô phỏng chỉ ra rằng protein ACE2 được ức chế bảo vệ khả năng ức chế theo thứ tự A1 > A3 > A4 > A2. So sánh với khả năng ức chế protein 6SVB nhận thấy thứ tự về khả năng ức chế thay đổi theo dãy A1 > A4 > A3 > A2. Giá trị độ lệch bình phương trung bình gốc (RMSD) trong các phức hợp nghiên < 2Å khẳng định tiềm năng ức chế. Khả năng ức chế được giải thích dựa vào sự khớp hình học giữa các thành phần tham gia. Các dẫn xuất của phenylpropene được đề xuất là các hợp chất tự nhiên tiềm năng trong việc hỗ trợ quá trình tìm kiếm các dược chất trong nghiên cứu ức chế SARS-CoV-2.